Assim que se formou, mudou a grafia de seu sobrenome para Menzel para melhor refletir a pronúncia da família Mentzel nos Estados Unidos.
Em 1995, Menzel fez o teste para Rent, que se tornou seu primeiro trabalho profissional. Rent abriu off-Broadway, New York Theatre Workshop em 26 de janeiro de 1996, mas mudou-se para Nederlander Theatre da Broadway, devido à sua popularidade.
Após o sucesso de Rent, Menzel lançou seu primeiro álbum solo intitulado Still I Can't Be Still pela gravadora Hollywood Records.
Menzel também originou o papel de Dorothy em Summer of '42 no Goodspeed Opera House, em Connecticut. Estrelou como Sheila na New York City Center Encores, em uma produção de Hair e apareceu na Broadway como Amneris em Aida. Ganhou um Drama Desk Award por sua atuação como Kate em The Wild Party. E participou do workshop pré Broadway de The Vagina Monologues.
Em 2003, Idina dividiu o palco com Kristin Chenoweth na produção original de Wicked, musical de Stephen Schwartz e WinnieHolzman. Menzel recebeu o Tony Award 2004 de Melhor Atriz em Musical por ter dado vida a Elphaba. No dia 8 de janeiro de 2005, Idina fazia sua penúltima apresentação em Wicked quando caiu em um alçapão e fraturou a costela, impedindo de participar de sua última apresentação no dia 9 de janeiro. Porém, Idina entrou no último número do espetáculo e foi ovacionada por mais de 5 minutos.
Em 2008 participou ao lado Kerry Ellis, Adam Pascal e Josh Groban. de Chess in Concert no papel de Florence Vassy
E ainda em 2008 participou do musical Nero de Duncan Sheik no papel de amante de Nero, Poppea.
Depois de um tempo se dedicando ao cinema e algumas series de TV, foi divulgado em Janeiro de 2013 que irá voltar aos palcos da Broadway como Elizabeth a protagonista de “If/Then”, espetáculo escrito e composto por Brian Yorkey e Tom Kitt.
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